1999年，某(🐽)个(🥇)东西被卡车运出了馆山(shān )市。几(jǐ )天(tiān )后，哥斯拉登(🔧)陆了馆山，特(tè )生自卫队(duì )(🏴)出(🗼)动与(yǔ )之展(zhǎn )开了苦战(zhàn )。在战(🎏)斗(❣)中，自(♑)卫队员家(🖲)城(⚫)茜（釈由美子 饰）意外(wài )害(hài )死了(le )战(✳)友叶山二尉（(🚥)森末慎二 饰），自己(🍮)却侥幸(😻)活(🚸)了下来(🐶)，并被派(😱)去(qù )了资料科。　　另一方(🔩)面(miàn )，日本政(🛑)府在(😞)柘植真智(zhì )子首相（水(㊗)野久(🥔)美 饰）(📙)的(🔝)指挥下，召(zhào )集了汤(tāng )原(yuán )(㊙)德光（宅麻(⛓)伸(shēn ) 饰(shì )）等科学家开始研究(🤲)对付(fù )哥斯拉的G兵器。他们(🐀)以(yǐ )在馆山冲挖掘(jué )出来(🗳)的初(🈁)代哥(💝)斯拉骨(🏉)骼为(🍑)基础，用了四(sì )年制成了机(jī )(🐛)械哥斯拉——3式机(💅)龙。柘(💹)植首相辞(cí )(😝)职，由科(💿)学技术(shù )厅长(📧)官五(😙)十岚隼人（中(zhōng )尾彬 饰）就任(rèn )新首相。同时(shí )，茜(qiàn )被派去了机龙队(🖍)，担(dān )(💣)任机龙的操作员。　　就(jiù )在(🕕)准备(bèi )机龙(lóng )测(🚻)试机(🔪)动(dòng )时，哥斯(sī )拉又(yòu )在东(❓)京湾(wān )(✖)出现了(🎴)。机龙赶赴现(xiàn )场与哥斯拉对战，却(què )因哥斯拉的吼(🈂)声唤醒了体内的野兽(shòu )灵魂(hún )，突(🈸)然暴走，在(zài )城市中(zhōng )造成了(le )大破(🏗)坏。　　为了(le )改(gǎi )良机(jī )龙，汤原改变了机龙DNA计(jì )算机(😻)的(de )(♈)碱构造，使机龙不会再受哥斯(sī )拉叫声(shēng )(📸)的干(🌽)扰。但由于对(🦄)再次(🔰)暴走的(de )担(dān )忧(🍐)，五十(🌮)岚迟迟不允许出动机龙。　　哥(😛)斯拉再(zài )度(dù )出(chū )现在东(🥖)京(⛄)湾(wān )，一(yī )路无视(shì )特生自卫(🙇)队(😯)的攻击(jī )来到了品川(💦)，令城(chéng )市(🔀)变成了一片火海。面对如此情景(jǐng )，五(wǔ )十岚终于同(🖨)意让机龙(lóng )出动。　　(⛹)为(👶)了打败(bài )哥斯拉，机(jī )龙被送到了品(pǐn )川。茜也抱着必死的(🎁)觉悟。机龙(lóng )和茜的战斗就这(zhè )样开始了。